Em 1976, o então magnífico reitor da Universidade Federal do Pará (UFPA), professor doutor Clóvis Cunha da Gama Malcher, e vários membros da academia defenderam a proposta de instituir uma fundação para desenvolver a pesquisa no Estado. Com a iniciativa da UFPA e da Associação Comercial do Pará, surgiria a Fundação de Amparo e Desenvolvimento da Pesquisa (FADESP), uma instituição privada autônoma e sem fins lucrativos.

A Fadesp foi, então, criada em 1976, após ser aprovada a resolução nº 370 pelo Conselho Superior de Ensino e Pesquisa da UFPA (CONSEP). A resolução é baseada no Decreto-Lei Nº 900, de 29 de setembro de 1969, sobre instituição de fundações. Em novembro de1977, a escritura pública da Fundação foi registrada em cartório, data considerada como nascimento da instituição.